作者:新聞中心來源:時間:2016-11-24 14:45:00
我校教師昝鄉鎮主持申報的項目《基于吸引域變化的基因調控網絡的干預研究》獲浙江省自然科學基金一般項目立項。
基因組學研究的一個主要的目的就是如何有效地的干預系統,使得系統朝人們期望的方向演化。本研究直接從吸引域結構的改變入手,研究基因調控網絡結構干預的方法和理論。我們主要開展了以下幾方面的研究:(1)我們在重疊基因降權(PADOG)方法基礎上提出了一種基于基因重要性和特異性的通路分析方法PAGIS。實驗結果表明,PAGIS方法比PADOG能夠提高很多癌癥相關的排名,從而提高癌癥相關通路的識別效果。此外,我們將基因的重要性和特異性考慮到SPIA方法中并提出SPIA_IS方法。數據結果表明:我們提出的方法可以識別更多的癌癥相關通路;(2)2016年我們提出的基于狀態域的最優干預算法可以明顯改進算法的時間復雜度,但是該算法的加過程和減過程非常復雜。 我們提出了凈狀態域(netBOSs)的概念。根據受干擾狀態的先后順序,可以很簡單的計算出其netBOSs,該方法不僅提高了時間效率,也簡化了計算過程。(3)我們提出了一種名為miR_SubPath的新方法,通過三個步驟來鑒定疾病相關的miRNA。數據結果顯示,所提出的miR_SubPath方法比先前的方法更強健并且可以鑒定更多的疾病相關的miRNA。(4)基于基因調控網絡的研究成果,我們將其應用到綜合航電系統安全性分析領域,提出的一種有效的算法可以快速預測系統安全是否發生故障,以及發生故障的條件下如何通過有效的干預,使得系統盡快恢復到期望的安全狀態。